Проблемы может быть три:
1. Неисправна помпа, сожрало лопасти или они прокручиваются относительно оси (если такой дефект возможен).
2. Неисправен термостат, заклинило в закрытом или полуоткрытом состоянии (распространенный дефект).
3. Засорился радиатор, нужно его промыть или заменить.
Неисправность помпы можно определить, сняв ее, менять желательно на оригинал или качественный дубль. Как советует boblov заодно поменять ремень ГРМ, ролик, сальники распредвала и коленвала (раз разобрали).
Неисправность термостата определяется по нагреву патрубка идущего от двигателя к радиатору. После запуска он должен быть холодным вплоть до набора рабочей температуры, потом резко нагреться. Если патрубок нагревается сразу или при рабочей температуре он недостаточно горячий, значит, термостат неисправен. С неисправным термостатом могут не включаться вентиляторы охлаждения и повышенный расход бензина, если у вас АКПП.
Засорение радиатора определить труднее, его нужно просто промыть или поменять.
И еще, чтобы такое не повторялось нужно промыть систему охлаждения и использовать качественный антифриз. Я лью G12 красный, за 6 лет владения машиной и 100ткм пробега никаких проблем (ГРМ менял после покупки, помпу не трогал). После прогрева стрелка температуры всегда стоит посередине шкалы как вкопанная, на морозе на скорости по трассе, и в пробке в жару. Сам удивляюсь совершенству системы охлаждения Honda CR-V RD1, по сравнению с другими машинами.
